在臨床上按照感染病原體的種類(lèi)分類(lèi),可以將醫(yī)院感染分為細(xì)菌感染、真菌感染、病毒感染、支原體感染、衣原體感染、立克次體感染、放線菌感染、螺旋體感染以及寄生蟲(chóng)感染等。
目前引起醫(yī)院感染的病原體以細(xì)菌和真菌為主,每一類(lèi)感染又根據(jù)病原體的具體名稱(chēng)而進(jìn)行分類(lèi),如:銅綠假單胞菌感染、白假絲酵母菌感染、柯薩奇病毒感染、肺炎支原體感染、沙眼衣原體感染、羌蟲(chóng)病、立克氏體感染、阿米巴原蟲(chóng)感染等。